vielleicht ist der mbr durcheinander gekommen? hatte ein ähnliches problem bei der installation von XP auf einem Rechner wo Vista zum testen mal installiert wurde... sowohl xp als auch vista liefen durch die installation durch (bei xp nur bis zum neustart nach dem textbasierten teil), aber das system ließ sich nachher nicht booten...
Allerdings hatte ich keine SATA-Platten in dem Rechner sondern (zum glück!) noch alte IDE Paltten, deswegen liess sich das Problem bei mir beheben, indem ich von einer DOS Bootdisk aus mit fdisk /mbr den Mbr halt neu geordnet hatte. anschliessend mit fdisk auch noch partitioniert und nach installation ließ xp sich wieder starten, und als dualboot läuft Vista mittlerweile auch wieder...