Komisch, aber: das Problem hat sich grad von selbst erledigt... Auf einmal funktionieren die Verknüpfungen, die Ordner werden wieder im Benutzerordner angezeigt wieder und man kann auch den Pfad wieder einstellen. Also irgendwie scheint Vista die im Hintergrund grad selber wieder gefunden zu haben (oder ich leide an Halozinationen).
Danke aber trotzdem für die Antworten :)