Hallo SteffiStefan,
zunächst einmal: Selbst, wenn der IE deaktiviert wird, bleibt er nach wie vor installiert, da Software, welche den Systembrowser verwendet (sprich: Windows-Funktionen zum Anzeigen von Webinhalten verwendet), auf ihn angewiesen ist (dieser stellt nämlich die entsprechende Infrastruktur). Den IE zu deaktivieren wirkt sich also nur insofern aus, dass der Benutzer ihn nicht mehr starten kann.
Da dessen Infrastruktur aber noch vorhanden ist, ist es ratsam, Updates für diese auch einzupflegen.