Also ich habe jetzt festgestellt, dass es klappt, wenn ich den auf 3306 laufenden lokalen MySQL Server 5.1 ausschalte.
Sonderbarerweise kann ich den auf Windows XP weiterlaufen lassen, die Puttyverbindung legt sich da drüber, also übernimmt den Port einfach.
Das ist wohl unter Windows 7 nicht mehr möglich.