Hab ich überprüft. Die erste liegt im Ordner "System32" (da wo sie ja auch liegen sollte) und die andere im Ordner "C:\Windows\winsxs\x86_microsoft-windows-commandprompt_31bf3856ad364e35_6.1.7600.16385_none_8ae31ce07bb01ee0".
Weitere Suchergebnisse sind außerdem "cmd.exe.mui", "cmdl32.exe.mui", "cmdkey.exe.mui", "cmdl32.exe", "cmdkey.exe" und noch mehr. Die genannten sind alle zweimal vorhanden, wovon sich eine wieder in System32 befindet und die andere in anderen Ordnern, welche alle mit "x86_microsoft-windows-commandprompt_" beginnen, der Rest ist dann wieder so ein toller Name ähnlich dem von der zweiten cmd.exe.
So sieht das aus:
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