Hast Du vielleicht im Bios "Booten von USB" als erste Priorität eingestellt? Wenn ja, dann "Booten von HD" oder "Booten von CD" einstellen.
Das Problem hatte ich auch einmal ähnlich, als ich vom USB-Cardreader booten wollte und versehentlich an einem anderen USB-Port ein Speicherstick eingesteckt war. Bis ich dann darauf gekommen bin...