Mit dem "Legacy USB Modus" hat das m. E. nichts zu tun. Das hat wohl eher, wie trantor sagt, mit den "Wake Up"-Einstellungen des Bios zu tun. Wenn Du sämtliche "Wake Ups" deaktivierst, dürfte sich das Problem ggf. lösen lassen. Wenn Du eine Funkmaus benutzt, hilft das aber vermutlich auch nichts, weil die, denke ich, immer bestromt wird.
Die ganzen "Wake Up"-Dinger kannst Du natürlich auch dadurch umgehen, daß Du Deinen PC stromlos machst, also physisch durch Umlegen eines Schalters vom Netz trennst.